Црква светог Николе у селу Крупац, крај Пирота, је подигнута током прве половине XVII века. Посвећена преносу моштију светог Николаја Мирликијског чудотворца. Налази се на месту које је због својих природних погодности коришћено још од античких времена. Фрескама је украшена унутрашњост цркве и њена западна фасада и највећим делом живопис је сачуван. Може се закључити, на основу иконографских особености, да је храм живописала грчка зографска радионица. У време Турака, зидови су прекречени до висине човечије а очи уста на фрескама су избодени од стране Турака. Црква је поново осликана 1866.године, али ни тај рад није у потпуности очуван. 1995. год извршена је реконструкција дотрајале припрате из 1866.год на чијем месту је изграђена савремена са тремом. Том приликом откривена су четири културна хоризонта, а најстарији припада ранохришћанској базилици из 5-6.века. Црквени комплекс данас чине, поред цркве Светог Николе, парохијски дом, добро очуван звоник, чесма са миљокљзима и пространо двориште.
Црква св.Николе у Крупцу је проглашена за споменик културе 1984.године.